全基因组检测分析平台将疑似病例基因分析缩至半小时

安卓在线 | 网络整理 | 2020-02-02 08:34

  【CNMO闻】浙江省疾控中心于2月1日上线自动化的全基因组检测阐明平台,浙江全基因组检测阐明平台由浙江省疾病防范节制中心、阿里达摩院医疗AI团队和杰毅生物技能公司配合研发。浙江省疾控中心基因测序认真人孙逸博士先容说,这个平台基于阿里云的强大算力与达摩院算法可觉得病毒的理会提供支撑,基于该平台,将来还可以在短时间内将检测范畴包围整个确诊病例,也为后续疫苗与药物研发打下了坚硬基本。

全基因组检测阐明平台将疑似病例基因阐明缩至半小时

  按照果真信息显示,新型冠状病毒全基因组序列全长29847bp,临床诊断需要将患者样本与该病毒基因序罗列办比对才气确定诊断功效。今朝医院普遍回收核酸检测要领,其只能检测到病毒基因的局部。由于病毒存在变异的大概性,对付整个基因序列来说这种检测要领犹如瞽者摸象,一旦病毒产生变异,就大概呈现漏检的环境。

全基因组检测阐明平台将疑似病例基因阐明缩至半小时

  新型冠状病毒肺炎疫情产生后,达摩院算法专家顾斐博士当即奔赴浙江省疾控中心,第一时间针对新型冠状病毒基因举办特征阐明,并推出多个算法模子。在序列比对进程中,达摩院对算法增加了漫衍式设计,有效晋升比对效率;在病毒序列拼接阶段利用漫衍式设计的de Bruijn图算法,变异病毒也能精准检测。

  自动化的全基因组检测阐明平台回收差异于核酸检测要领的全基因组检测技能,对疑似病例的病毒样本举办全基因组序列阐明比对,可以或许有效防备病毒变异发生的漏检。平台上线后,可将本来数小时的疑似病例基因阐明缩短至半小时,大幅缩短确诊时间,并能精准检测出病毒的变异环境。大幅提高疑似病例简直诊速度和精确率。

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